Si bien no pudo superar la fase de grupos en Corea/Japón 2002, su estreno absoluto en una fase final de la Copa Mundial de la FIFA, distinta fue la historia en Alemania 2006, donde se metió entre los mejores 16 tras ganar dos partidos y terminar segundo en su zona detrás de la selección anfitriona. Sin embargo, la Tricolor chocó allí con Inglaterra, que puso fin a su sueño al imponerse por 1-0.
Después de 2006, Ecuador volvió a clasificarse para Brasil 2014, luego de unas eliminatorias peculiares: mientras de local resultó imbatible (ganó todos los partidos, salvo el empate contra Argentina), de visitante era un cheque al portador. Aun así, logró colarse en cuarto lugar, gracias a la diferencia de goles. En el Mundial, jugó contra Suiza, Honduras y Francia, y quedó eliminada luego de perder contra Suiza, vencer a Honduras y empatar contra Francia. Para el Mundial de Qatar, calificó en cuarto lugar, de la mano de Gustavo Alfaro y un grupo de jugadores que alterna experiencia y juventud. En un grupo de pronóstico reservado, Ecuador podría dar la sorpresa.
